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Esse erro que não é um erro e sim um (Aviso) esta sendo comum no Kali Linux, quando se vai usar JAVA ele na verdade não afeta em nada na construção do seu código, porém por questões estéticas alguns se incomodam, então será mostrada a solução desse aviso.
Primeiramente todo o comando que você executar terá que usar o SUDO.
Código:
# sudo nano /etc/X11/Xsession.d/90kali-themes.conf
Nesse arquivo você ira deletar a linha do Java Option completa.
Código:
# sudo nano /etc/environment.d/95kali-themes.conf Nesse arquivo também tem uma linha do Java Option, e você deverá deleta-la também.
Enfim, feito isso reinicie seu computador e tem executar um código Java, e logo você verá que esse aviso não ira mais aparecer...
Espero ter te Ajudado.